Кластер (практическое руководство)

Программное обеспечение можно скачать здесь: http://linux-cluster.org.ru/download/

Кластер
Практическое руководство по параллельным вычислениям

РАБОТА С КЛАСТЕРОМ BCCD
Прежде чем начать работу с кластером необходимо сформировать конфигурационный файл, описывающий машины, составляющие кластер и являющийся простым списком адресов компьютеров кластера. Этот файл понадобится команде mpirun при запуске программы. Для автоматического получения этого файла необходимо выполнить команду bccd-snarfhosts. После выполнения этой команды в домашнем каталоге пользователя bccd появится файл machines, который мы и будем использовать для запуска программ.

Для демонстрации/проверки работы кластера попробуем оттранслировать и выполнить простейшую программу, реализующую алгоритм нахождения числа , и на основе этого алгоритма вичисляющую быстродействие узлов и всего кластера в целом.

Для этого создадим в домашнем каталоге пользователя bccd директорию flops и поместим туда исходный текст нашей программы. Программу мы можем взять с винчестера, разделы котрого доступны через каталог /mnt/rw/discs или с дискеты, подмонтировав ее в какой-нибудь каталог.

Далее компилируем эту программу:

cd ~/flops
mpif77 ./flops.f -o flops

Для запуска полученного исполняемого модуля программу следует скопировать на все узлы кластера. Выполнить это можно с помощью команды:

bccd-syncdir ~/flops ~/machines

Это команда создает в каталоге tmp подкаталог со случайным названием, копирует туда содержимое каталога ~/flops и рассылает этот каталог по всем узлам кластера. В конце работы команда выводит на экран информацию о проделанной работе.

В данном конкретном случае исполняемы модуль нашей программы был перенесен в каталог /tmp/66ec4433. Теперь мы готовы запустить параллельную программу на исполнение. Сделать это можно с помощью следующей команды:

mpirun -np 3 -machinefile ~/machines /tmp/66ec4433/flops

Этой командой ма запускаем программу на исполнение на трех процессорах из числа тех, что перечислены в файле ~/machines. Результатом работы нашей программы может быть следующее:

 HPC Test ---------------------------------------------
 Number of processors	=   3
 Total time		=   1.93351775 seconds
 Cluster speed		=   930 MFLOPS
 Node  0 speed		=   310 MFLOPS
 Node  1 speed		=   311 MFLOPS
 Node  2 speed		=   539 MFLOPS

Из приведенного листинга видно, что мы запустили программу параллельно на трех компьютерах, два из которых - машины класса Intel Celeron 1.8GHz, и третья более мощная класса Pentium IV. Используемые компьютеры показали быстродействие порядка 300 и 540 MFlops (миллионов операций с плавающей точкой в секунду). Эффективное же быстродействие кластера оказалось почти 1 GFlops. Таким образом мы получили трехкратный выйгрыш в скорости.

Оглавление

Download

Полезные ссылки